水生动物微生态学是从细胞水平认识和研究水生动物、微生物和水体环境三者关系的一门新兴学科。研究表明，当养殖对象处于健康状态时，鱼虾蟹类内外环境中有一个相对稳定的有益菌占优势的正常微生物种群，这个种群是抵抗致病菌的第一道防线。当水温、PH值、应激、残饵、污染物等环境突变，或者传染性病毒病菌侵入鱼虾蟹肌体造成肌体抵抗力下降时，有益菌占优势的稳定性被破坏，处于遏制状态下的“静态”的致病菌被激活，病原便会突破“防线”，导致鱼虾蟹等养殖对象出现一系列病理变化而发病。应用EM原露等微生态制剂添加到养殖水体和饲料中去，使有益微生物经常处于优势状态，是从微观生态方面防治水产动物疾病的新的生态方法，在生产实践中发挥着越来越大的作用。

EM原露是日本琉球大学比嘉照夫教授发明的新型复合微生态制剂，含五科10属80多种有益微生物。其菌种能利用有机酸、氨、硫化氢及小分子有机物促进自身繁殖，同时降解和清除水体环境中过量的有机物和有害物质，防止水体富营养化，提高水体的溶解氧，达到净化水质、改善水环境的目的。用作饵添加剂时，能降低胃肠道的PH值，产生多种消化酶，分泌大量的维生素和菌体蛋白，提高鱼虾蟹的免疫力，在提高鱼虾蟹对饲料的消化吸收率、防治病害的发生、提高孵化率和苗种的成活率、促进鱼虾蟹类的健康生长方面具有多种良好的性能。
检测资料显示：用1个PPM的EM泼洒水体，能净化和改善水质，保持养鱼水质的有效期达21-35天，溶解氧平均提高48-59%，氨氮下降57-83%，PH值升高0.64。泼洒后可大幅减少鱼虾蟹病的发生和用药量。用EM原露发酵料或浸泡饲料养殖鱼虾蟹可提高其孵化率、生长率和成活率，改善肉质。在河蟹、鳜鱼、南美白对虾、鲍鱼上应用，EM原露可有效控制和防治病毒病的发生。实践还进一步证明：应用EM原露防治病害，以预防为主，苗种期为主最为有效；全期使用、发酵使用为最佳。在水产养殖上的应用方法介绍如下：
 
一、预防使用。
（1）改良淤泥底质。可先按常规方法清塘除野，在药性消失后，排尽池水，在池底湿润时按亩用2公斤的用量泼洒塘底，并翻动淤泥。一星期后进水，同时按1公斤/亩全池泼洒，再按常规下肥培育水质。此种方法最适宜鱼虾蟹苗种的孵化和培育。
（2）制作EM原露发酵肥。用猪粪、鸡粪等堆垛干燥，水份在40%左右时，与红糖、EM拌和密封发酵7-15天。发酵肥可作基肥或追肥。粪肥、EM原露、红糖按300-500:1:1的比例配比，EM原露可适量稀释，但粪肥的总水份控制在45%内。EM原露发酵肥可大量繁殖有益菌，分解有毒有害物质，提供大量菌体蛋白，促进浮游动物生长，活化水质。
（3）水体泼洒。一是EM直接泼洒：用池水将EM稀释200-300倍后全池泼洒，用量1公斤/亩或1个PPM，20天左右泼洒一次。二是制成EM原露发酵稀释液后泼洒：先用温开水将红糖溶化，加入5-10倍的清洁水密封发酵24-48小时后再稀释泼洒，亩用量1公斤，每隔30-40天泼洒一次。此法主要用于净化水质，保持池水肥活爽。
（4）常年制作EM原露发酵饲料或浸泡饲料投喂（方法略），水体消毒可用EM原露或生石灰。
二、治疗使用。
（1）遇缺氧、浮头、水体混浊、透明度低时，按1-2个PPM的用量直接泼洒或加入等量红糖发酵后泼洒。浮头缺氧在3-5小时内恢复正常；4-7天达养鱼水质要求。
（2）轻度发病，水体按1-2个PPM全池泼洒，同时按2-3%的比例稀释8-10倍后拌于饲料或喷洒于颗粒饲料上，连续投喂5-7天，颗粒料喷洒EM稀释液后须立即投喂。病情严重时，可先按常规方法使用消毒剂、中草药等资料1个疗程（最多2个疗程），待药性消失后全池泼洒EM或拌入饲料投喂，以确保以后无重大病害发生。
 
实践证明，应用EM原露防治鱼虾蟹疾病，常规鱼类用药量可减少50-70%，特种水产养殖可不使用任何抗生素药物。EM原露是生产安全、无药残的无公害绿色水产品的有效措施。